回到国内后，蒋经国接受父亲的安排闭门读书。
抗日战争爆发后，蒋经国结束了宁静的读书生活，由奉化到了重庆。不久，政学系首脑、江西省政府主席熊式辉迎合蒋介石的心意，于1938年1月任命蒋经国为江西省保安处少将副处长。这是蒋经国回国后政治舞台上扮演的第一个角色。
蒋经国也很想去江西施展一下他从苏联学到的一套本事，很快就走马上任。蒋经国到职后不久，就与仅仅想借"太子"自重而并不欲蒋经国有所作为的熊式辉发生了矛盾，结果，熊式辉把蒋经国从实权之位的保安处调出，改任虚职"江西政治讲习院"学生总队总队长。1938年5月，熊式辉又以江西省政府的名义发表公告，任命蒋经国为江西省保安司令部新后督练处长，让他离开南昌到赣州集训保安团队。
新兵督练处设在临川温泉。蒋经国搬用苏联军队的思想政治工作方法来"改造"国民党旧军队。他首先提出，连队要经济公开，赏罚公开，不准打骂士兵，不准克扣士兵伙食，注意改善士兵生活。其次，他积极采取措施开展"康乐活动"以活跃官兵精神，造成朝气蓬勃的气象。对于军官教育，他则反复宣传王阳明学说。他还遵从乃父蒋介石的一贯作法，把《增补曾胡治兵语录》、戚继光《纪效新书(练兵实记)》等列为军官必读书籍。他在作风上也与众不同，不作威作福，经常深入连队同官兵一起吃住。很快，赣州的新兵训练出现了新气象，蒋经国声名大振。
后来，蒋经国把这一段督练亲兵的过程，编了一本《温泉练兵实纪》，借以宣扬自己练兵的成绩，同时也是向父亲交了"考试答卷"。蒋介石对儿子初涉政界、军界即崭露头角十分得意，曾指示国民党一些部队派人到江西新兵督练处参观。
临川温泉练兵，是蒋经国事业的开端，为他以后在政治、军事上的发展奠定了一个比较扎实的基础。
1939年3月，熊式辉任命蒋经国为江西省第四行政区督察专员，6月又加任保安司令，接替已声名狼藉的复兴社分子刘已达，公署在赣州。蒋经国成为赣南大权统揽于一身的最高行政长官，第一次独当一面"工作"了。
蒋经国初到赣南，便提出一个"建设新赣南"的提纲草案，并得到蒋介石的首肯，大加赞赏。
1940年，蒋经国正式公布"新赣南建设三年计划"，提出了建设新赣南五大目标、人民的义务与权利、新赣南精神建设五大目标，新赣南人四大要件、理想政治、现代国民、新的人生观、新赣南家训、官民合作公约等九项具体措施。
在蒋经国在治理整顿下，原本落后混乱的赣南也的的确确出现了一些新气象，给人以耳目一新之感，"蒋青天"的称号竟成为一时之誉，经过国民党的大力宣传，前来参观者络绎不绝。蒋介石对其子在建设新赣南中取得的政绩也十分满意。
1940年6月以前，蒋经国还不是国民党员和三民主义青年团员。直到这年6月，他带职到重庆中央训练团党政班第3期受训一个月，才取得国民党员和三民主义青年团员的资格。从此，他在三青团的地位便迅速擢升。7月，被任命为三青团临时中央干事。8月，又被指定为三青团江西支团筹备主任。于是，他在赣州赤蛛岭举办"三民主义青年团江西支部干部训练班"，自己当主任。
在这里，他把从苏联学来的联系群众的方式，与中国传统道义的精神糅合起来，在"青干班"的生活和训练中强调"同心同德、患难与共"，要求不分男女，都以"兄弟"相称，号召"效忠团长"(蒋介石)、"主任"(蒋经国)。这就是后来大肆宣扬的"赤蛛岭精神"。赣州"青干班"共办了5期，训练学员500余人。这批干部后来成了蒋经国"嫡系中的嫡系"。
赣州"青干班"时期，由于蒋经国与学员过从甚密，曾酿出过一段恋情。学员中有一女生叫章亚若，为人活泼，又颇具姿色，很快成为蒋经国的红粉知己。另一名学员王升，与章亚若拜过把，当章、蒋发生恋情时，王升从中效力，成为隐秘的"国舅"。因此王升后来成为蒋经国"心腹的心腹"。章、蒋恋情的结晶便是一对双胞胎，即后来的台湾政局新人章孝严、章孝慈兄弟。
章亚若在生下章氏兄弟后，便暴死在广西桂林医院，关于章亚若死因，至今仍是个谜。
1943年12月，蒋经国出任"三青团中央干部学校"教育长。
这是蒋介石早有蓄谋地培植蒋经国取代康泽以控制三青团的一招棋。随即，蒋经国由赣南基地，率领一批嫡系人马，进抵"陪都"重庆"复兴关"，在众兄弟们的协助下，他很快在"青干校"扎下了根，没多久就掌握了"青干校"的实权，将康泽排挤出局。1945年，康泽经蒋介石批准赴欧美考察，蒋介石子承父业的初步计划开始一步步实施。
1944年11月，在蒋介石的亲自安排下，蒋经国出任知识青年从军征集委员会委员。在开始编练"青年军"时，蒋介石借口要加强"青年军"的政治工作，决定以蒋经国任"青年军"编练总监部的政治部主任，军衔中将，后又兼任"青年军"政工人员干部训练班主任。
这样，"青年军"政治部和各师政治部的人事全由蒋经国一手独揽，随即蒋经国完全控制了青年军的整个政工系统。从此，蒋经国的政治势力由三青团扩展到国民党军队，并在国民党各派系中开辟了一席之地。
1948年，随着国民党军事上的全面溃败，国民党统治区的经济形势也急剧恶化，通货膨胀，物价飞涨，几近崩溃的边缘。为了挽救经济危机，支撑内战，蒋介石把"币制改革"看成是起死复生的灵丹妙药。
8月，蒋介石颁布经济紧急处分令，决定发行金圆券代替法币，限期收兑金、银、外币，整理财政并加强经济管制，以8月19日为最高限价日，强行规定全国各地物品及劳务价格。蒋介石为加强管制，在上海、天津、广州设立三个大经济管制区，特派俞鸿均、张厉生、宋子文为督导员，蒋经国、王抚州、霍宝树为协助督导员，赋予行政及警察指挥大权。
但是，由于触动孔祥熙的家族利益，蒋经国导演"打老虎"这场全本武戏，历时70天，终于被迫草草收场。1948年11月1日，国民党政权的"经济改革"的讣闻正式公布，明令取消"限价"政策。11月6日，回天无力的蒋经国悄然离开了上海，返回杭州蒋寓。
1949年初，蒋家王朝在大陆的统治已呈风雨飘摇、朝不保夕之势。为了苟延残喘，蒋介石放出"和谈"烟雾，第三次下野，推出李宗仁在前台收拾"烂摊子"。自己则开始转在幕后进行实际操纵，以图东山再起，卷土重来。
正式引退前，蒋介石公布和任命了陈诚为台湾省主席、蒋经国为台湾省党部主任委员。接着蒋介石令蒋经国再赴上海，将中央银行3．7亿美元的黄金、白银和外币移存台湾；下台伊始，又指派蒋经国督建定海机场，为国民党军队败退台湾做准备，开始营造退路。
蒋介石下野后，蒋经国以蒋介石全权代表的身份，全面介入国民党军政要务，无论是大西南组织反攻，还是东南、华南撤退，蒋经国往返奔波，台前幕后，亲自操纵指挥。
结果，1949年2月26日，中共中央公布内战战犯名单，蒋氏父子均赫然在列。
4月15日，国共和谈代表在北平举行第二次会议，中共代表团提出《国内和平协定》最后修正案，并指出4月20日为最后签字期限，逾期不签字，将表示谈判破裂，人民解放军将立即过江。这一天，正值蒋经国40岁生辰，蒋介石特书"寓理帅气"四字匾额，附跋，表示的心意文曰："每日晚课，默诵孟子母养气章。十五年来，未尝或间，自于此略有领悟。又常玩索存心养性之性字，自得四句曰：无声无臭，惟虚惟微，至善至中，寓理帅气。为之自箴，而以寓理之寓字，初认深切，引为自快，以代私视；并期其能切己体察，卓然自强，而不负所望耳。"
除此之外，蒋介石又题："立敬立极"、"法天自然"八字。
蒋经国接到父亲的题词，显得非常激动，见人就说："凡此所言，希望于我愈深，亦鞭策于我翕力，此后修养治事，定以此为准绳。"
1949年4月21日，中国人民解放军百万雄师分三路强渡长江。23日占领南京，蒋家王朝在大陆的统治正式宣告覆亡。
紧接着，西南解放，12月10日，蒋介石、蒋经国父子由成都飞往台北，永别了中国大陆。 |
